세금계산서 금액수정, 공급가액 변동 시 처리 방법

공급가액이 변경되었다면 ‘취소’가 아닌 ‘수정세금계산서’ 발행이 원칙입니다. 감액·증액 처리 방법부터 실수 방지 팁까지 한 번에 확인하세요.
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Aug 08, 2025
세금계산서 금액수정, 공급가액 변동 시 처리 방법

사업을 하다 보면 거래 후 공급가액이 변경되는 상황이 종종 발생합니다.
예상보다 낮은 금액으로 계약이 정리되었거나, 일부 품목이 빠졌거나, 환불이 발생했을 수도 있죠.
이럴 경우, 이미 발행한 전자세금계산서를 그대로 둘 수 없기 때문에 ‘수정세금계산서’를 발행해야 합니다. 이번 글에서는 공급가액 변동에 따른 세금계산서 금액수정 방법과 수정 시 주의사항을 정리해 드립니다.

공급가액 변동 시, 수정세금계산서로 처리해야 합니다

전자세금계산서를 이미 발행했는데, 공급가액에 변동이 생겼다면 ‘취소 후 재발행’이 아닌 ‘수정세금계산서 발행’이 원칙입니다.

국세청 기준에 따르면 공급가액이 변동된 경우 아래와 같은 방식으로 수정 발행을 해야 합니다.

볼타 수정발행 - 공급가액 변동
볼타 수정발행 - 공급가액 변동

1. 공급가액이 감액된 경우

  • 원래 세금계산서의 공급가액을 마이너스(-)로 기재한 수정세금계산서 발행

  • 예시: 최초 발행 1,000,000원 → 감액 후 700,000원일 경우 → -300,000원 수정 발행

2. 공급가액이 증액된 경우

  • 증액분만큼 추가로 작성한 수정세금계산서 발행

  • 예시: 최초 발행 1,000,000원 → 증액 후 1,200,000원일 경우 → +200,000원 수정 발행

발행 기한

  • 거래일이 속한 달의 다음달 10일까지 수정 발행을 완료해야 가산세가 발생하지 않습니다.

수정 시, 자주 실수하는 포인트

  • 사유 코드 선택 오류: 단순 감액/증액이더라도 잘못된 수정사유를 선택하면 가산세 대상이 될 수 있습니다.

  • 기존 세금계산서와의 연동 미비: 수정세금계산서에는 반드시 기존 발행 건의 정보가 연결되어야 합니다.

홈택스 수기 발행의 한계

많은 실무자들이 여전히 홈택스를 통해 수기 방식으로 수정세금계산서를 발행하고 있습니다. 하지만 다음과 같은 불편함이 존재하죠.

  • 세금계산서 조회 기간, 1개월 이내만 설정 가능

  • 잘못된 수정사유 선택 시 실수 위험이 높음

  • 입력 오류 시 다시 처음부터 작성해야 함

복잡한 과정을 매번 반복하다 보면 실수 확률도 높아지고, 그만큼 가산세 위험도 커집니다.

복잡한 수정 발행, 볼타로 간편하게

볼타에서는 공급가액 변동으로 인한 수정세금계산서도 정확하고 간편하게 처리할 수 있습니다.

볼타 세금계산서 수정발행
볼타 세금계산서 수정발행

볼타 수정세금계산서 기능의 강점

  • 국세청 기준 수정사유 자동 적용

  • 세금계산서 조회 기간, 한 달 이상 설정 가능

  • 기존 전자세금계산서에서 바로 ‘수정 발행’ 버튼 클릭만으로 이어서 작성 가능

  • 감액/증액 여부에 따라 자동 계산된 금액 표시

  • 수정 발행 내역 히스토리 자동 저장

특히, 반복적인 수정을 줄이고자 할 때는 사전 발행 검토 기능이나 세금계산서 예약 발행 기능을 함께 활용해 보는 것도 추천드립니다.

볼타 수정세금계산서 기능 자세히 보기

수정 세금계산서 발행 시, 자주 묻는 질문

Q. 기존 세금계산서를 취소하고 새로 발행하면 안 되나요?

A. 전자세금계산서는 ‘취소’ 개념이 없습니다.
공급가액이 변경된 경우, 기존 세금계산서를 기준으로 변동된 금액에 대한 수정세금계산서를 별도로 발행해야 합니다.
예를 들어 금액이 감액되었다면 마이너스(-) 금액으로 수정 발행해야 하며, 증액되었다면 그 차액만큼 추가로 수정 발행해야 합니다.

Q. 홈택스 외에 다른 서비스로도 수정세금계산서를 발행할 수 있나요?

A. 네, 가능합니다. 볼타와 같은 전자세금계산서 발행 서비스를 이용하면 국세청 요건을 충족하면서도 더 간단하고 안전하게 수정 발행을 처리할 수 있습니다.

Q. 수정세금계산서를 여러 번 발행해도 되나요?

A. 네, 기존 세금계산서에 대해 여러 건의 수정세금계산서를 발행할 수 있습니다.
예를 들어 공급가액이 순차적으로 여러 번 변경되거나, 일부 품목 환불과 추가 공급이 반복되는 경우 각각에 대해 별도 수정세금계산서를 발행하면 됩니다.
단, 각 수정 건마다 적합한 사유를 선택해서 수정발행해야 하며, 마감일(익월 10일)을 지켜야 가산세를 피할 수 있습니다.

공급가액 변동은 모든 사업자에게 발생할 수 있는 일입니다.
하지만 그에 대한 처리 방식은 명확하게 알고 있어야 세무 리스크를 줄일 수 있습니다.

복잡한 국세청 기준도, 까다로운 발행 절차도 볼타와 함께라면 실수 없이 정확하게 관리할 수 있습니다.

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